O uso do md5 é realmente muito importante para garantir a integridade de arquivos baixados da rede, mas a checagem de arquivos pode ser mais simples ao utilizarmos a chave -c.
Vejamos um exemplo:
Name Last modified Size
ubuntu-9.10-server-amd64.iso 27-Oct-2009 15:06 655M
MD5SUMS 29-Oct-2009 10:09 634
O arquivo md5 fornecido pela distribuição tem a chave de verificação de várias imagens de cd/dvd. Veja o conteúdo deste arquivo MD5SUMS:
836440698456aa2936a4347b5485fdd6 *ubuntu-9.10-alternate-amd64.iso
3faa345d298deec3854e0e02410973dc *ubuntu-9.10-alternate-i386.iso
dc51c1d7e3e173dcab4e0b9ad2be2bbf *ubuntu-9.10-desktop-amd64.iso
d91659de6e945dbb96eb8970b2b4590a *ubuntu-9.10-desktop-armel+dove.img
297875d2a7531824a0fb08f241d33e85 *ubuntu-9.10-desktop-armel+imx51.img
8790491bfa9d00f283ed9dd2d77b3906 *ubuntu-9.10-desktop-i386.iso
ed6e77587b87fe0d92a2f21855869f00 *ubuntu-9.10-netbook-remix-i386.iso
14707e8847b9c9ba2dd1869fb5086e4f *ubuntu-9.10-server-amd64.iso
55618ad5f180692f9dac20cbff352634 *ubuntu-9.10-server-i386.iso
37a04db193b1a342f961f59aea2fada8 *wubi.exe
A linha deste arquivo que nos interessa foi a que deixei em negrito que corresponde à imagem de cd que eu baixei. Depois de baixar a imagem do cd e o arquivo md5, você pode verificar se o download deu certo digitando a linha de comando abaixo:
md5sum -c MD5SUMS
O resultado deste comando vai apresentar falhas por não encontrar os arquivos que eu não baixei, apenas ignore estes erros e procure pela linha da imagem que você tem no hd.
O resultado deve ser o abaixo:
ubuntu-9.10-server-amd64.iso.md5: A soma coincide
Se aparecer a mensagem A soma não coincide você terá que baixar o cd/dvd novamente.
Espero ter ajudado


